Este motivo lleva a destituir al técnico vasco, que es sustituido por Nacho Fernández de forma interina y por Alejandro Menéndez de forma definitiva. Tras pagar la cláusula de rescisión, Ángel Viadero se despide del equipo y el club busca nuevo entrenador, encontrándolo en la figura de Paco Fernández. La nueva Junta Directiva se plantea dos objetivos claros e irrenunciables; el primero y el más importante, es el saneamiento económico del club y el siguiente la consolidación y crecimiento deportivo. Tras una mediocre temporada y con la afición pidiendo la dimisión de la junta directiva en la mayoría de los partidos jugados como local, se consigue la salvación a falta de 2 partidos para finalizar la liga. En la temporada 2012/13, el club tiene como única meta el ascenso a la Segunda División B. Se confecciona una plantilla competitiva con jugadores profesionales. La celebración de la promoción de ascenso en formato exprés, supresión de descensos.

A cuatro jornadas para el final cae a posición de promoción de permanencia. El Burgos CF finalizó el año 2020 en la decimocuarta posición del Grupo 2, con seis partidos ganados, cinco empatados y nueve perdidos. La temporada 2018-19 es de continuo sufrimiento para el equipo que coquetea todo el año con el descenso. Un año más tarde, el 7 de julio de 2017, se anunciaría la inclusión del videoarbitraje (Video Assistant Referee, VAR). La licitación municipal publicada prevé que los agentes puedan adquirirla mediante vales que se pueden gastar solo durante cinco meses al año, de julio a noviembre. Pronto empiezan los problemas entre el entrenador Julio Bañuelos y el director deportivo en la confección de la plantilla. La temporada 2015/16, el equipo es dirigido por Ángel Viadero, que hace las veces tanto de entrenador como de director deportivo. En la temporada 2016/17, el club sigue militando en el grupo I de Segunda División B. El entrenador para dirigir el proyecto es el mismo que acabó la temporada anterior, Ángel Viadero.

En el hogar de Ángel Savatelli, se juntaron los gestores de la entidad con la idea de constituir un cuadro poderoso. Con la idea de este nuevo torneo de 30 equipo Belgrano trae refuerzos como Sebastián Prediger, Sergio Escudero, Mauro Óbolo y la vuelta de un querido jugador como él Chiqui Pérez. Este convenio queda pendiente de revisión con la futura conclusión de las obras. En pretemporada, el Racing de Santander se pone en contacto con el entrenador y este acepta la oferta de los cántabros. En la temporada 2006/07, Gonzalo Arconada es el entrenador y se prepara un equipo con ilusiones de ascenso. Fabri toma el mando en el banquillo y consigue clasificar al equipo para el play off de ascenso. 18/07 El Córboba ha anunciado la incorporación al equipo de Domingo Cisma para las próximas tres temporadas. Firma por dos temporadas y percibirá unos 7 millones de euros por cada una.

En 2007, el escudo sufre una de sus mayores modificaciones para adaptar la imagen del club a la era digital, simplificando trazos y creando un diseño final con gran calidad y válido para todo tipo de trabajos. Pero con tan solo dos partidos ganados en siete jugados durante el Torneo Apertura 2010, González fue destituido como DT del club. Todos ellos juegan y preparan sus partidos en los distintos terrenos de juego de la Ciudad Deportiva Luis del Sol con un campo principal de capacidad para 3 500 espectadores. En Perú el amarillo representa al Partido Solidaridad Nacional, partido de centroderecha presidido por el exalcalde de Lima Luis Castañeda Lossio. Ante esta situación, el virrey decidió evacuar Lima por temor a ser expuesto al ataque de San Martín, quién logró ocupar la ciudad con un batallón de patriotas. Juventud del Círculo Católico y que estaba situado en lo que es hoy el patio del Colegio de la Milagrosa; entre las calles Molinillo, San José y Ramón y Cajal, próximo al actual complejo científico-cultural sobre la Evolución Humana. Lo que hoy llamamos opinión pública o democracia no es en gran parte sino la purulenta reacción de esas almas rencorosas”. En 2019, se estimó que el país tenía un potencial de generación estimado energía eólica de alrededor de 522 GW (esto, solo en tierra), energía suficiente para satisfacer tres veces la demanda actual del país.

Los socios compromisarios, cuya condición necesita del aval de otros tres socios, se eligen cada cuatro años. La Copa América 1989 se disputó nuevamente en territorio brasileño, cuarenta años después. En la Copa Libertadores de América sus mejores actuaciones se dieron en las ediciones de 1990, 1994, 2014 y 2017 cuando alcanzó los octavos de final. Tras negociar con los jugadores impagados, el club consigue que retiren las denuncias y así poder competir en Tercera División. En mayo de 2019, el empresario y dirigente del fútbol argentino Antonio Caselli adquirió el 90% de las acciones del Burgos Club de Fútbol. En la era de los Caselli se relanzó la Fundación Burgos Club de Fútbol, a cargo de Julián Alonso y Candela Blanco. En la Campaña de Abonados 2019-2020 el club superó por primera vez los 5.000 abonados estando fuera del fútbol profesional. En la primera eliminatoria, el equipo es eliminado a manos del filial Levante «B». Pronto el equipo se pone líder del grupo VIII de la Tercera División y ya no lo soltaría hasta el final de liga, consiguiendo el noveno título de esta división en la historia del club.